تاریخ تولد ۴۵/۴/۷
در آغازنوجوانی ، با شرکت در جماعات مذهبی و مطالعه کتب دینی ، خصوصا آثار شهید دستغیب ، پایه ایمانی و اعتقادی اش را تثبیت و روز به روز محکم تر کرد.
درسال 61 به عضویت بسیج مسجد محل ( مسجد رضایی) در آمد و با وجود کمی سن وسال ، دوره آموزشی را با موفقیت پشت سر گذاشت و در اواخر همان سال به عنوان بسیجی ، از طریق پایگاه مالک اشتر به جبهه اعزام شد ودر شهریور سال 62 به عضویت رسمی سپاه پاسداران درآمد.
در جبهه مدتی جزو نیروهای عادی بود و در همین ایام تحصیلاتش را نیز دنبال می کرد. وی سپس مسئول تسلیحات گردان تخریب لشکر 27 محمد رسول الله (صلّی الله علیه و آله ) شد و بعد از آن معاونت یکی از گردان های تخریب را با فرماندهی [شهید] محسن دین شعاری برعهده گرفت.
در تاریخ 20 بهمن64 عملیات والفجر 8 با رمز " یا فاطمة الزهرا " (علیها سلام) آغاز شد . سید جعفر در این عملیات نیز حضور یافت و چهار روز بعد از شروع عملیات ، همزمان با سالروز شهادت جده اش حضرت صدیقه طاهره (علیها سلام)، در شهرفاو، جاده امّ القصر، بر اثر اصابت ترکش خمپاره به پهلو ، دست و گردن ، به فوز عظیم شهادت نائل گشت وجسم پاکش درقطعه 53 بهشت زهرا (سلام الله علیها) در کنار دیگر همرزمان شهیدش به خاک سپرده شد.
از جمله خصوصیات بارز شهید احترام به والدین ، توجه به فقرا و افراد کم بضاعت، ساده زیستی ، مهربانی ، خلق خوش ، بهره گیری صحیح ازفرصت ها و ایام فراغت و به خصوص توجه ویژه به واجبات را می توان نام برد . او نماز را با توجه و صوتی خوش می خواند و اعضای کوچک خانواده را به این فریضه شرعی و احترام به آن تشویق می کرد .
وی در اجتماعات عبادی و سیاسی و هرجایی که احساس می کرد حضورش کمک به این نظام است شرکت داشت . مانند راهپیمایی ، نماز جمعه ، هیئات مذهبی ، انتخابات و کمک های پشت جبهه و... . حتی در وصیت نامه اش نیز به این مسأله تأکید کرده بود که باید پشتیبان ولایت فقیه باشیم و این انقلاب را امتحان الهی بدانیم و در حفظ و سربلندی آن کوتاهی نکنیم
فرازی از وصیت نامه شهید سید جعفر خاتمی :
... و ای امت شهید پرور ، ای یاران امام ، ای کسانی که به حق ثابت کردید که تمامی تان آمادگی جان فدا کردن را برای اسلام دارید ؛ بدانید که این انقلاب و جنگ یک امتحان الهی است و باید مواظب باشید که در این امتحان سربلند و سرافراز و موفق باشید .
... عزیزان مبادا در پیشبرد این انقلاب کوتاهی کنید و به والله اگر در این برهه از زمان کوتاهی کنید ، در روز قیامت جوابگوی آن نخواهید بود.
پس ای یاران امام زمان (عجّل الله تعالی فرجه الشریف) مواظب باشید که مبادا به ولایت فقیه کوتاهی شود و به امام و دولت لطمه ای وارد شود و در خاتمه از تمامی شما التماس دعا دارم.