اطلاعاتی از تاریخ روستای بالاخانی در اطراف باکو بالاخانی روستای فارس (تات یا پارس هم میگویند) است. نام روستا از دو کلمه فارسی بالا و خانه گرفته شده است. در سال 1427 مقبره شاکر آقا پسر وزیر شیروانشاه اول ابراهیم در اینجا برپا شد و در سال 1538 بالاخانی به تصرف صفویان درآمد