تفاوت موضوع و مسأله موضوع یک زمینه کلی است که درباره آن تحقیق می‌­کنیم؛ مثل: توحید، قرآن شناسی، تاریخ قرآن، عصمت و… اما مسأله از آن جزیی­‌تر است. رابطه موضوع و مسأله مانند رابطه کشور و شهر است. درباره موضوع می­‌توان مطالعه کرد اما تا زمانی که محدود نشود نمی­‌توان به عنوان یک مسأله پژوهشی در آن کار کرد. بنابراین «توحید» موضوع است و «رابطه توسل با توحید عبادی» یک مسأله است.